Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YIPF6Q96EC8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YIPF6Q96EC8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms