Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms