Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms