Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms