Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms