Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms