Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms