Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms