Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2A3Q8NEV1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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