Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC191Q8NCU4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms