Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms