Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms