Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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