Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms