Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms