Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms