Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM29Q5VYK3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms