Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf84Q5VXU9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms