Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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LRRC38Q5VT99 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRC38Q5VT99 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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