Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACER2Q5QJU3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACER2Q5QJU3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms