Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9Q5K651 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms