Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms