Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FGD3Q5JSP0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms