Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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