Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms