Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC184Q52MB2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC184Q52MB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms