Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms