Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms