Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms