Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms