Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MICAQ29983 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MICAQ29983 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms