Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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COL24A1Q17RW2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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COL24A1Q17RW2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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COL24A1Q17RW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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