Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC142Q17RM4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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