Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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