Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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