Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LAMA4Q16363 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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LAMA4Q16363 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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