Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZFHX3Q15911 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms