Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SS18Q15532 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SS18Q15532 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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