Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX1-1Q15270 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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