Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAPTM4AQ15012 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAPTM4AQ15012 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAPTM4AQ15012 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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