Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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