Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GPNMBQ14956 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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