Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms