Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms