Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNIQ14094 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms