Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms