Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms