Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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