Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
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SHROOM2Q13796 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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