Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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